Het begeleiden en uitvoeren van farmaceutisch (praktijk)onderzoek ligt aan de basis van SIR. Meten is weten waarmee SIR de farmaceutische zorg beoogt te verbeteren. SIR voert onderzoek uit in het kader van promotietrajecten,  landelijke, regionale of lokale farmaceutische zorgprojecten en de SIR Masterclass farmaceutisch praktijkonderzoek.  Voor de promotieonderzoeken wordt samengewerkt met de Universiteit Leiden, de Universiteit Utrecht, de Radboud Universiteit  Nijmegen. Ook peilt SIR de praktijk van de apotheekmedewerkers over prangende farmaceutische onderwerpen via PAM. SIR is coördinator van het farmaceutisch praktijkonderzoek binnen de KNMP Vervolgopleiding tot openbaar apotheker specialist.